Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms