Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms