Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc28aQ8CEI3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms