Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp27Q8CEG8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms