Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Snx30Q8CE50 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx30Q8CE50 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx30Q8CE50 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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