Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms