Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dclre1bQ8C7W7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dclre1bQ8C7W7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms