Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q8C708 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8C708 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8C708 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8C708 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8C708 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8C708 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms