Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4bQ8C6J9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Nlrp4bQ8C6J9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Nlrp4bQ8C6J9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Nlrp4bQ8C6J9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Nlrp4bQ8C6J9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Nlrp4bQ8C6J9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Nlrp4bQ8C6J9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Nlrp4bQ8C6J9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Nlrp4bQ8C6J9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Nlrp4bQ8C6J9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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