Protein–RNA interactions for Protein: Q8C494

Prr33, Proline-rich protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr33Q8C494 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prr33Q8C494 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms