Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ccdc90bQ8C3X2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ccdc90bQ8C3X2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ccdc90bQ8C3X2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ccdc90bQ8C3X2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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