Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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