Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Y1

Tgif2, Homeobox protein TGIF2, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif2Q8C0Y1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif2Q8C0Y1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif2Q8C0Y1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms