Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D0

Trub1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub1Q8C0D0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trub1Q8C0D0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms