Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser1Q8C0C4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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