Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Trim35Q8C006 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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