Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Iffo1Q8BXL9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Iffo1Q8BXL9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Iffo1Q8BXL9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Iffo1Q8BXL9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Iffo1Q8BXL9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Iffo1Q8BXL9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Iffo1Q8BXL9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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