Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

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Length 3,748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Vps13cQ8BX70 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vps13cQ8BX70 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vps13cQ8BX70 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vps13cQ8BX70 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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