Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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