Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubr7Q8BU04 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubr7Q8BU04 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms