Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms