Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD5

She, SH2 domain-containing adapter protein E, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SheQ8BSD5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SheQ8BSD5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SheQ8BSD5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms