Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rd3Q8BRE0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms