Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hirip3Q8BLH7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms