Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pum3Q8BKS9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pum3Q8BKS9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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