Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nop53Q8BK35 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nop53Q8BK35 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nop53Q8BK35 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nop53Q8BK35 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nop53Q8BK35 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nop53Q8BK35 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nop53Q8BK35 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nop53Q8BK35 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nop53Q8BK35 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms