Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup93Q8BJ71 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms