Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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