Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfascQ810U3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms