Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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