Protein–RNA interactions for Protein: Q80YA8

Crb2, Protein crumbs homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb2Q80YA8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Crb2Q80YA8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crb2Q80YA8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms