Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms