Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ8

Mis18bp1, Mis18-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18bp1Q80WQ8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mis18bp1Q80WQ8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18bp1Q80WQ8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18bp1Q80WQ8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18bp1Q80WQ8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18bp1Q80WQ8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18bp1Q80WQ8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18bp1Q80WQ8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18bp1Q80WQ8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18bp1Q80WQ8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18bp1Q80WQ8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18bp1Q80WQ8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18bp1Q80WQ8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18bp1Q80WQ8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18bp1Q80WQ8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18bp1Q80WQ8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18bp1Q80WQ8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18bp1Q80WQ8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18bp1Q80WQ8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18bp1Q80WQ8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mis18bp1Q80WQ8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms