Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

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Length 524 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lrrc1Q80VQ1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc1Q80VQ1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms