Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dsg1bQ7TSF1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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Dsg1bQ7TSF1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Dsg1bQ7TSF1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Dsg1bQ7TSF1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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Dsg1bQ7TSF1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms