Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap2lQ7TS74 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms