Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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