Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms