Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sbno2Q7TNB8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms