Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms