Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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