Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ncapd3Q6ZQK0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms