Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms