Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPE2

Sbf1, Myotubularin-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf1Q6ZPE2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sbf1Q6ZPE2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf1Q6ZPE2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms