Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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