Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms