Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad54bQ6PFE3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms