Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtifQ6PEE2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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