Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trak1Q6PD31 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms