Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atl2Q6PA06 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atl2Q6PA06 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms